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篩選合適的健康糞便捐贈者(donor)來進行微菌叢植入治療主要的目的是避免可能經由微菌叢移植導致受贈者的感染，以及避免受贈者產生和微菌叢可能相關聯的疾病。製備來自非親屬的捐贈者的糞便來成立糞便微菌庫(stool
bank)，這是目前國外的共識上較建議的。目前捐贈者篩檢的流程如下：(1)問卷確立病人的病史：需要藉此來評估以釐清條件確認捐贈者的醫療病史，以過濾任何血液與糞便檢驗中無法測出的風險因子；(2)血液以及糞便檢驗：通過血液以及糞便檢驗標準後四周內捐贈糞便；(3)
健康人通過了問卷以及血液和糞便的檢驗後，成為符合資格的糞便捐贈者，必須在四周內開始捐贈糞便。捐贈糞便的當天需再次以簡單的問卷篩檢來確立這段時間內確認沒有發燒、全身性或消化道的任何症狀。捐贈後已製備的糞便根據國外的建議會先進入檢疫期，等待再次檢驗捐贈者的血液以及糞便來確認捐贈者健康狀況後，才會讓製備完成的糞便微菌叢使用於病人。捐贈者健康狀況長期追蹤包含問卷以及相關的檢驗也是必需的。篩選合適的健康糞便捐贈者實務的運作的困難是高成本、實驗室檢驗資源的限制，以及低的篩檢成功率。許多未確立的議題，也有待更多的經驗來制定出共識。（臨床醫學
2019; 84: 569-73） |
